Tuxcueca se localiza al centro–sureste de Jalisco, en las coordenadas 20° 04' 10" a los 20º 14' 15" de latitud norte y a los 103° 22' 30" a 103º 22' 30" de longitud oeste; a una altura de 1530 metros sobre el nivel del mar.

El municipio colinda al norte con el municipio de Chapala; al este con los municipios de Chapala y Tizapán el Alto; al sur con los municipios de La Manzanilla de la Paz y Teocuitatlán de Corona; al oeste con los municipios de Teocuitatlán de Corona y Jocotepec.

Orografía

Su superficie está conformada por zonas semiplanas (55%), lomas y laderas, con elevaciones desde los 1,570 a los 1,700 metros sobre el nivel del mar; zonas accidentadas (28%) que presentan elevaciones de los 1,700 a los 2,600 msnm, y la parte norte que colinda con el Lago de Chapala pertenece a las zonas planas (17%), con alturas que van de los 1,500 a los 1,570 msnm.

Suelos

El territorio está conformado por terrenos que pertenecen al período cuaternario. La composición de los suelos es de tipos predominantes Feozem Háplico y Vertisol Pélico. El municipio tiene una superficie territorial de 29,894 hectáreas, de las cuales 4,950 son utilizadas con fines agrícolas, 3,700 en la actividad pecuaria, 10,400 son de uso forestal, 139 son suelo urbano y 705 hectáreas tienen otro uso, no especificándose el uso de 10,000. En lo que a la propiedad se refiere, una extensión de 21,972 hectáreas es privada y otra de 7,922 es ejidal; no existiendo propiedad comunal.

Hidrografía

Este municipio pertenece a la cuenca hidrológica Lerma-Chapala-Santiago, subcuenca Chapala-Río de la Pasión. Sus principales arroyos son: Las Carreteras, San Antonio, El Zalate, El Zacate, El Salto y la Calera. Además del Lago de Chapala, están las presas de Las Cebollas, La Cañada y El ahijadero y algunos bordos.

Clima

El clima es semiseco, con otoño, invierno y primavera secos, y semicálido, sin cambio térmico invernal bien definido. La temperatura media anual es de 19.5 °C, con máxima de 25.1 °C y mínima de 13.8 °C. El régimen de lluvias se registra en los meses de junio y julio, contando con una precipitación media de 742.7 milímetros. El promedio anual de días con heladas es de 8.8. Los vientos dominantes son en dirección del noroeste y suroeste.

Flora y fauna

Las lomas y laderas están cubiertas por pequeña vegetación y por pastos naturales. Los cerros están cubiertos generalmente por encino, existiendo pino en los lugares más altos.

El venado, el conejo, la ardilla, algunos reptiles y especies menores habitan en esta región.